Program Listing for File scipy-allocator.hpp
↰ Return to documentation for file (include/eigenpy/scipy-allocator.hpp
)
/*
* Copyright 2024 INRIA
*/
#ifndef __eigenpy_scipy_allocator_hpp__
#define __eigenpy_scipy_allocator_hpp__
#include "eigenpy/fwd.hpp"
#include "eigenpy/eigen-allocator.hpp"
#include "eigenpy/scipy-type.hpp"
#include "eigenpy/register.hpp"
namespace eigenpy {
template <typename EigenType, typename BaseType>
struct scipy_allocator_impl;
template <typename EigenType>
struct scipy_allocator_impl_sparse_matrix;
template <typename MatType>
struct scipy_allocator_impl<
MatType,
Eigen::SparseMatrixBase<typename remove_const_reference<MatType>::type> >
: scipy_allocator_impl_sparse_matrix<MatType> {};
template <typename MatType>
struct scipy_allocator_impl<
const MatType, const Eigen::SparseMatrixBase<
typename remove_const_reference<MatType>::type> >
: scipy_allocator_impl_sparse_matrix<const MatType> {};
// template <typename MatType>
// struct scipy_allocator_impl<MatType &, Eigen::MatrixBase<MatType> > :
// scipy_allocator_impl_sparse_matrix<MatType &>
//{};
template <typename MatType>
struct scipy_allocator_impl<const MatType &,
const Eigen::SparseMatrixBase<MatType> >
: scipy_allocator_impl_sparse_matrix<const MatType &> {};
template <typename EigenType,
typename BaseType = typename get_eigen_base_type<EigenType>::type>
struct ScipyAllocator : scipy_allocator_impl<EigenType, BaseType> {};
template <typename MatType>
struct scipy_allocator_impl_sparse_matrix {
template <typename SimilarMatrixType>
static PyObject *allocate(
const Eigen::SparseCompressedBase<SimilarMatrixType> &mat_,
bool copy = false) {
EIGENPY_UNUSED_VARIABLE(copy);
typedef typename SimilarMatrixType::Scalar Scalar;
typedef typename SimilarMatrixType::StorageIndex StorageIndex;
enum { IsRowMajor = SimilarMatrixType::IsRowMajor };
typedef Eigen::Matrix<Scalar, Eigen::Dynamic, 1> DataVector;
typedef const Eigen::Map<const DataVector> MapDataVector;
typedef Eigen::Matrix<StorageIndex, Eigen::Dynamic, 1> StorageIndexVector;
typedef Eigen::Matrix<int32_t, Eigen::Dynamic, 1> ScipyStorageIndexVector;
typedef const Eigen::Map<const StorageIndexVector> MapStorageIndexVector;
SimilarMatrixType &mat = mat_.const_cast_derived();
bp::object scipy_sparse_matrix_type =
ScipyType::get_pytype_object<SimilarMatrixType>();
MapDataVector data(mat.valuePtr(), mat.nonZeros());
MapStorageIndexVector outer_indices(
mat.outerIndexPtr(), (IsRowMajor ? mat.rows() : mat.cols()) + 1);
MapStorageIndexVector inner_indices(mat.innerIndexPtr(), mat.nonZeros());
bp::object scipy_sparse_matrix;
if (mat.rows() == 0 &&
mat.cols() == 0) // handle the specific case of empty matrix
{
// PyArray_Descr* npy_type =
// Register::getPyArrayDescrFromScalarType<Scalar>(); bp::dict args;
// args["dtype"] =
// bp::object(bp::handle<>(bp::borrowed(npy_type->typeobj)));
// args["shape"] = bp::object(bp::handle<>(bp::borrowed(Py_None)));
// scipy_sparse_matrix =
// scipy_sparse_matrix_type(*bp::make_tuple(0,0),**args);
scipy_sparse_matrix = scipy_sparse_matrix_type(
Eigen::Matrix<Scalar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic>(0, 0));
} else if (mat.nonZeros() == 0) {
scipy_sparse_matrix =
scipy_sparse_matrix_type(bp::make_tuple(mat.rows(), mat.cols()));
} else {
scipy_sparse_matrix = scipy_sparse_matrix_type(bp::make_tuple(
DataVector(data),
ScipyStorageIndexVector(inner_indices.template cast<int32_t>()),
ScipyStorageIndexVector(
outer_indices.template cast<int32_t>()))); //,
// bp::make_tuple(mat.rows(),
// mat.cols())));
}
Py_INCREF(scipy_sparse_matrix.ptr());
return scipy_sparse_matrix.ptr();
}
};
// template <typename MatType>
// struct scipy_allocator_impl_sparse_matrix<MatType &> {
// template <typename SimilarMatrixType>
// static PyArrayObject *allocate(Eigen::PlainObjectBase<SimilarMatrixType>
// &mat,
// npy_intp nd, npy_intp *shape) {
// typedef typename SimilarMatrixType::Scalar Scalar;
// enum {
// NPY_ARRAY_MEMORY_CONTIGUOUS =
// SimilarMatrixType::IsRowMajor ? NPY_ARRAY_CARRAY : NPY_ARRAY_FARRAY
// };
//
// if (NumpyType::sharedMemory()) {
// const int Scalar_type_code = Register::getTypeCode<Scalar>();
// PyArrayObject *pyArray = (PyArrayObject *)call_PyArray_New(
// getPyArrayType(), static_cast<int>(nd), shape, Scalar_type_code,
// mat.data(), NPY_ARRAY_MEMORY_CONTIGUOUS | NPY_ARRAY_ALIGNED);
//
// return pyArray;
// } else {
// return NumpyAllocator<MatType>::allocate(mat, nd, shape);
// }
// }
// };
#if EIGEN_VERSION_AT_LEAST(3, 2, 0)
// template <typename MatType, int Options, typename Stride>
// struct scipy_allocator_impl_sparse_matrix<Eigen::Ref<MatType, Options,
// Stride> > {
// typedef Eigen::Ref<MatType, Options, Stride> RefType;
//
// static PyArrayObject *allocate(RefType &mat, npy_intp nd, npy_intp *shape)
// {
// typedef typename RefType::Scalar Scalar;
// enum {
// NPY_ARRAY_MEMORY_CONTIGUOUS =
// RefType::IsRowMajor ? NPY_ARRAY_CARRAY : NPY_ARRAY_FARRAY
// };
//
// if (NumpyType::sharedMemory()) {
// const int Scalar_type_code = Register::getTypeCode<Scalar>();
// const bool reverse_strides = MatType::IsRowMajor || (mat.rows() == 1);
// Eigen::DenseIndex inner_stride = reverse_strides ? mat.outerStride()
// : mat.innerStride(),
// outer_stride = reverse_strides ? mat.innerStride()
// : mat.outerStride();
//
// const int elsize =
// call_PyArray_DescrFromType(Scalar_type_code)->elsize; npy_intp
// strides[2] = {elsize * inner_stride, elsize * outer_stride};
//
// PyArrayObject *pyArray = (PyArrayObject *)call_PyArray_New(
// getPyArrayType(), static_cast<int>(nd), shape, Scalar_type_code,
// strides, mat.data(), NPY_ARRAY_MEMORY_CONTIGUOUS |
// NPY_ARRAY_ALIGNED);
//
// return pyArray;
// } else {
// return NumpyAllocator<MatType>::allocate(mat, nd, shape);
// }
// }
// };
#endif
// template <typename MatType>
// struct scipy_allocator_impl_sparse_matrix<const MatType &> {
// template <typename SimilarMatrixType>
// static PyArrayObject *allocate(
// const Eigen::PlainObjectBase<SimilarMatrixType> &mat, npy_intp nd,
// npy_intp *shape) {
// typedef typename SimilarMatrixType::Scalar Scalar;
// enum {
// NPY_ARRAY_MEMORY_CONTIGUOUS_RO = SimilarMatrixType::IsRowMajor
// ? NPY_ARRAY_CARRAY_RO
// : NPY_ARRAY_FARRAY_RO
// };
//
// if (NumpyType::sharedMemory()) {
// const int Scalar_type_code = Register::getTypeCode<Scalar>();
// PyArrayObject *pyArray = (PyArrayObject *)call_PyArray_New(
// getPyArrayType(), static_cast<int>(nd), shape, Scalar_type_code,
// const_cast<Scalar *>(mat.data()),
// NPY_ARRAY_MEMORY_CONTIGUOUS_RO | NPY_ARRAY_ALIGNED);
//
// return pyArray;
// } else {
// return NumpyAllocator<MatType>::allocate(mat, nd, shape);
// }
// }
// };
#if EIGEN_VERSION_AT_LEAST(3, 2, 0)
// template <typename MatType, int Options, typename Stride>
// struct scipy_allocator_impl_sparse_matrix<
// const Eigen::Ref<const MatType, Options, Stride> > {
// typedef const Eigen::Ref<const MatType, Options, Stride> RefType;
//
// static PyArrayObject *allocate(RefType &mat, npy_intp nd, npy_intp *shape)
// {
// typedef typename RefType::Scalar Scalar;
// enum {
// NPY_ARRAY_MEMORY_CONTIGUOUS_RO =
// RefType::IsRowMajor ? NPY_ARRAY_CARRAY_RO : NPY_ARRAY_FARRAY_RO
// };
//
// if (NumpyType::sharedMemory()) {
// const int Scalar_type_code = Register::getTypeCode<Scalar>();
//
// const bool reverse_strides = MatType::IsRowMajor || (mat.rows() == 1);
// Eigen::DenseIndex inner_stride = reverse_strides ? mat.outerStride()
// : mat.innerStride(),
// outer_stride = reverse_strides ? mat.innerStride()
// : mat.outerStride();
//
// const int elsize =
// call_PyArray_DescrFromType(Scalar_type_code)->elsize; npy_intp
// strides[2] = {elsize * inner_stride, elsize * outer_stride};
//
// PyArrayObject *pyArray = (PyArrayObject *)call_PyArray_New(
// getPyArrayType(), static_cast<int>(nd), shape, Scalar_type_code,
// strides, const_cast<Scalar *>(mat.data()),
// NPY_ARRAY_MEMORY_CONTIGUOUS_RO | NPY_ARRAY_ALIGNED);
//
// return pyArray;
// } else {
// return NumpyAllocator<MatType>::allocate(mat, nd, shape);
// }
// }
// };
#endif
} // namespace eigenpy
#endif // ifndef __eigenpy_scipy_allocator_hpp__